Buenas!
La verdad que las compras que propones son muy parecidas, yo tengo el megane 2.0dci y como comparación mi hermano tiene el a3 2.0tdi.
El megane va muy bien es muy regular consumos ajustados y baja sonoridad en frio, bastante diferente a los tdi, lo que mas me gusta del a3 de mi hermano son las calidades, esto es muy diferente en audi y en seat asi que no te ayuda mucho; Si los compras nuevos el tdi seria common rail asi que lo primero que te comente tampoco habria mucha diferencia, jejejeje vaya consejos no??
Lo mejor es que sigas criterios de diseño, a mi personalmete me gustaba mas el megane, el leon me parece bastante aburrido, son coches muy poco originales, no arriesgan en diseño.
En cuanto a fiabilidad no hay muchas quejas, la verdad, solo me jode la egr esa de los huev.... pero seat tambien la tiene asi que no creo que sea mejor. llevo 100.000km y esta como nuevo, tiene cadena de distribución asi que un ahorrito pa el bolsillo, jejeje
Bueno espero que al menos te quite dudas sobre fiabilidad y demas, no creo que el leon te aporte mas que el megane ni viceversa, solo hay diferencias notables en dinero, consumos, potencia, precios taller etc.. todo eso ya te lo pone en las revistas, lo mejor es que te compres el que ma te guste esteticamente, un saludo y suerte con la compra