Hola calamar y bienvenido.
Supongo que te vas habituando a él y le vas sacando "defectos" y de ahí que notes las vibraciones que al principio te pasaban desapercibidas.
Sobre el rodaje, un coche es un mecanismo complejo y hay que rodar todos sus componentes. Es mejor siempre, rodarlo yendo tranquilo por una carretera de curvas dando un pasaeo, usando el cambio, el embrague, los frenos, teniendo que acelerar a la salida de cada curva... todo con suavidad. En autopista se ruedan mal porque no se usa el embrague, ni los frenos, el motor va siempre a un mismo régimen...
Y no hay que agobiarse. No apures el coche, ni lo dejes muerto como bien dices, martilleando. Manten el coche entre 1500 y 2500 rpm y vete poco a poco subiéndole el régimen con aceleraciones suaves.